应该是从遥远的宇宙彼方K隆星来侵略地球的KERORO小队，在剧场版中却将地球从可怕的危机中拯救出来……这一次，KERORO军曹的面前出现了最新！最恶！最强的敌人！！ 故事讲述冬树与KERORO小队一起去印加帝国的马丘比丘足迹参观，喜欢神秘事物的冬树当然是大为高兴，可是KERORO的脑袋里面装满了要侵略地球的事情。他们在那里因为迷路而发现了遗迹，后来因为突发状况而不得不从那里逃出。但在那时，冬树一瞬间看见了一位伫立在迷途中的少女。抱着对少女的不解之迷，冬树与KERORO回到了东京。不过这时，最强的敌人出现在了他们面前。样子和KERORO一模一样，但与KERORO不同天空対決戦ｔテンクウたい的是，他是要迅速且透彻地策划侵略地球的黑暗KERORO。他带领着部下CIBABA、DORURU、MIRURU一起在世界各国开始了侵略行动。而迎击这一切的KERORO小队的命运是？……
未知
演员：本城雄太郎 藤原启治 名冢佳织 宫本佳那子 大桥彩香 小见川千明 中村千绘 纳谷六朗 泽木郁也 后藤哲夫 岛香裕 松浦爱弓 东山奈央 藤村步 加藤优子 春名风花 水泽史绘 畠山航辅 木内秀信 野岛昭生 桐本拓哉 酒井敬幸 藤田圭宣 堀胜之祐 井上和彦 远近孝一 佐佐木敏 木村雅史 楠见尚己 小村哲生
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